一般的玻璃儀器先用自來水沖洗，然后用常規洗劑擦洗，再用自來水清洗，后用水沖洗三次；精密或難刷的器皿（移液管、容量瓶、錐形瓶等）先用自來水沖洗，瀝干，用洗液浸泡后，再用自來水沖洗，后用純水沖洗；一個洗凈的玻璃器皿應不沾油污，不掛水珠，否則應重新洗，直至達到要求為止。
使用全自動洗瓶機對玻璃器皿的標準清洗如下：
預洗冷水清洗，70℃水溫堿性清洗劑清洗，用酸性清洗劑中和清洗，軟化水清洗，純水清洗，純水漂洗（高95℃）。清洗全部結束。
全自動洗瓶機的維護保養注意事項：
1、洗瓶機的清洗程序很重要，請一定要遵照廠家給出的參考程序，水溫，水循環量，清洗劑的用量，漂洗的次數對器皿的潔凈指數都是有很高的要求。
2、對套筒滾子鏈、進瓶系統、出瓶系統、回程裝置的軸承，每班加一次潤滑脂；鏈盒驅動軸、萬向聯軸節等其他軸承每兩班加一次潤滑脂；各變速箱每季檢查一次潤滑情況，需要時應更換潤滑油。
3、要經常注意觀察各部位動作是否同步，有無異常響聲，各處緊固件有否松脫，液溫和液位是否符合要求，水壓、汽壓是否正常，噴嘴及濾網有否堵塞及清洗，軸承溫度是否正常，潤滑是否良好。一旦發現不正常情況，應及時處理。
4、每次更換洗液、排放廢水時，對機內要進行全面沖洗，去除污垢及碎玻璃，清刷疏通過濾筒。
5、每季應對加熱器用高壓水噴洗一次，對蒸汽管路上污物過濾器和液位探測器清洗一次。
6、每月刷洗噴管，疏通噴嘴，及時調整噴管對中情況。
7、每半年檢查各種鏈條張緊器，需要時加以調整。
